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衣原体肺炎与颈动脉增厚、中风有关.
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中风：美国心脏协会杂志（Stroke:Journal of the American Heart Association）七月刊发表文章：颈动脉中、内膜增厚和局部缺血性中风都与衣原体肺炎感染有关。瑞士哥德堡Sahlgrenska大学医院的Bjorn Fagerberg博士领导的一个多中心小组，检测了113位接受治疗的男性高血压 高血压患者的颈总动脉中-内膜厚度和斑块情况。每个病例至少存在一种危险因素，包括高胆固醇血症、吸烟或糖尿病。
抗衣原体肺炎抗体血清浓度测定（IgM，IgA，IgG和循环免疫复合物）与B超检查测量的颈动脉中-内膜厚度及斑块形成有关。至少有56位病人上述血清浓度升高，57位病人血管中-内膜厚度增加而无血清浓度升高。
Fagerberg博士的小组发现，单独抗体类型和循环免疫复合物浓度升高也与血管中-内膜厚度增加有关。血清反应阳性的病人，收缩期血压高于无循环免疫复合物的病人。
这些资料表明，抗体效价水平提示衣原体肺炎的持续性感染，这也与颈动脉粥样硬化改变和将来心血管疾病发病的危险有关。
作为/北曼哈顿中风研究/（Northern Manhattan Stroke Study）的一部分，纽约哥伦比亚大学的Mitchell S.V.Elkind 博士和一个多中心小组，对89例首次发生局部缺血性中风的病人与从社区随机选取的89位健康对照者进行比较研究。他们检测了衣原体肺炎的特异性IgG，IgA和IgM抗体的效价。
研究人员发现，衣原体肺炎IgA血清浓度与局部缺血性中风明显相关。这种关系在青年与老年、男性与女性、白人和黑人及西班牙人均得到证实。IgG水平与中风的关系相对较弱，所有病例均无IgM水平升高。
抗衣原体治疗能否降低中风的危险仍然不清楚。是否需要进行抗衣原体治疗依病情而定，这可能是综合因素当中的一个因素。许多的感染可能导致动脉粥样硬化形成，但作为诱因之一的衣原体肺炎所起的作用还有待证实。